学校始建于1958年,最早是衡阳矿冶工程学院。2000年原隶属国家核工业部的中南工学院、核工业第六研究所与原隶属湖南省政府的衡阳医学院合并组建成南华大学。
2004年中国人民解放军(海军)在学校设立后备军官选拔培训基地,又新成立了国防生大队(同学院级别,单独设置)。由原隶属中国核工业总公司的中南工学院、核工业第六研究所与原隶属湖南省的衡阳医学院合并组建而成。
南华大学前身是南京大学。
南华大学的前身,最早是1958年创办的衡阳矿冶工程学院,2000年与中南工学院和衡阳医学院合并组建成南华大学.。