1、核弹爆炸
美国原子弹之父罗伯特·奥本海默看过死丘事件之后，认为它和核弹袭击没什么分别。再加上考古发现现场有核爆相同的幅射含量，地面上还残留着遭受冲击波和核辐射的痕迹，所以有人估计是当时发生核弹爆炸，甚至认为史前文明曾经有过核技术。
很多人猜测可能是人类存在的史前文明，一部分世人被自己创造的高科技武器毁灭，留下小部分成为"亚当""夏娃"，几千年后的今天，人们又周而复始地开始研制大规模杀伤性武器，人类最终不是败给了自然，而是败给了自己。
2、黑色闪电
前苏联一些科学家研究过之后，认为摩亨佐达罗城的死丘事件并不是因为核子爆炸而毁灭，他们认为是一种叫黑色闪电的天文现象造成。黑色闪电是一种非常罕见的自然现象，它是由于大气里面经过太阳辐射、宇宙射线和电场之后形成的活跃微粒，这些微粒在电磁场反应之下，又会聚在一齐，好似滚雪球似的越滚越大，变成一个有大有细的球。
科学家认为，形成黑色闪电的大气条件，会产生很多有毒气体，摩亨佐达罗城的人首先是被这些有毒气体先毒死，之后发生爆炸，当一个黑色闪电爆炸，其它会跟随接连爆炸，温度可以升高到15000度，而爆炸产生的冲击波，就把整个摩亨佐达罗城瞬间毁灭掉，而造成现在的死丘事件。这种黑色闪电现象其实非常罕见，不过在1983年8月12日墨西哥萨卡特卡天文台就真的拍到张黑闪电，证明真的有这种东西。
3、外星人飞船爆炸
西方有些学者又提出，那可能是外星人的核动力"宇宙飞船"发生故障，在古城上空很近的地方突然爆炸，造成了这场核灾难，毁灭了古城而变成死丘。然而"外星人"是否存在至今还是一个未解之谜，以谜解谜也显证据不足。死丘事件也可能是外星人的核动力"宇宙飞船"发生爆炸但这些猜测都没有确切的理论支持，所以至今印度"死丘"还是个谜。
